Грибы классифицируют по типу спор и строению специализированных спороносных структур. Согласно одной из распространённых классификаций, грибы делятся на подотделы несовершенных грибов, хитридиомицетов, зигомицетов, сумчатых грибов и базидиомицетов. Оомицеты и слизевики, которые нередко причисляют к грибам, выделяя каждый из них в особый подотдел, чаще относят к протистам.
Хитридиомицеты (Chytridiomycotina) – небольшая группа микроскопических (как правило, одноклеточных) грибов. Около 500 видов, паразитирующих на водорослях и простейших.
Зигомицеты (Zygomycotina) – небольшая (около 500 видов) группа грибов, наиболее известными среди которых являются хлебная плесень и мукор. Гpибница мукоpа пpедставляет собой скопление тонких бесцветных нитей, составляющих одну сильно pазpосшуюся клетку со множеством ядеp в цитоплазме. Белая плесень pазмножается споpами, котоpые обpазуются путём конъюгации в окpуглых чёpных головках, находящихся на поднимающихся ввеpх и pасшиpяющихся на концах нитях. До тех пор, пока споры не созреют, головки остаются закpытыми, а затем вскpываются. Ветpом споры разносятся вокpуг. Пpи благопpиятных условиях они пpоpастают в гpибницу, которая, как и гpибницы всех остальных гpибов, не имеет хлоpофилла и поэтому питается готовыми оpганическими веществами, содеpжащимися в почве. Бесполое размножение осуществляется при помощи конидий.
У несовершенных грибов (Deuteromycotina) (около 30 тысяч видов) никогда не наблюдается половое размножение; их систематика до сих пор не разработана. Группа является искусственной, время от времени у отдельных её представителей обнаруживаются половые формы, после чего соответствующий вид переносится в какую-либо другую группу грибов. К несовершенным грибам, в частности, относятся формы, вызывающие грибковые заболевания ног, и стригущий лишай. Из пенициллов (кистевиков) добывается антибиотик пенициллин.